（一） 建立完善的科技投入体系
1.明确农业的公益性定位，大幅增加政府对农业科技的投入
农业科技的发展具有其独特的特点，主要是受影响的自然因素多，风险大，科技成果周期长，知识产权的市场垄断性差，再加上它的目标用户多数是农民，农业的弱质性和农业科技的特点决定了它是一种公益性事业。虽然广东社会经济发展很快，农业产值在GDP中所占的比例越来越少，但农业的公益性基础性地位未发生变化，广东仍然是农业大省（在全国排第四位，出口排第二位），农业人口有近5000万，“三农”问题是困扰广东进一步发展的瓶颈，农业又担负着为社会提供安全食品和良好生态环境的责任。随着市场经济发展，一些企业也会逐步扩大对农业科技的投入，但是在较短的时间内政府投入主体的格局基本不会改变。在“十五”期间，虽然广东对农业科技的投入不断增加，但目前仍只占农业总产值的0.2%，低于世界平均1%的水平。“十一五”期间，要遵循“工业反哺农业、城市支持农村”的方针，同时也符合加入WTO后增加绿箱支持的原则，政府财政要大幅增加农业科技的投入，争取到2010年达到农业总产值的0.5%水平。
2.采取鼓励政策，引导社会对农业科技的多元化投入
广泛利用国内外社会资金，采取鼓励政策，引导国内外企业进入农业科技领域。各级政府和有关部门建设投资和各类专项资金安排上要向技术含量高的项目和高新技术产业倾斜，政策性农业金融机构为农业科技提供优惠信贷支持，税务、工商部门给予农业科技型企业以更大的优惠条件，建立和完善科技风险投资和融资担保体系，形成促进农业科技创新和成果转化的资本运作机制。
（二） 健全农业科技人才队伍建设
1.重点建设好科技创新、技术推广两支队伍，培养农业院士与学科带头人
通过省公共实验室、重点实验室、重点学科建设，结合重大科技计划和人才培养计划，以任务带动人才培养，造就一批适应21世纪农业科技发展、具有国际科技竞争能力的精干、高效的农业科技优秀人才队伍。并培养广东的农业学科带头人群体，在优势领域造就数位在国内外有一定影响力的农业院士。尤其要加强农业高新技术人才的培养和引进，优化和提高农业科技人才整体性、群体性结构，在2010年使从事产前、产中、产后研究的人员比例达到2:5:3。
采取多部门参与、多层次办学、多形式办学、多学科教育、多功能服务的办法，建立一支有文化、懂技术、会管理的农民技术队伍，使其成为农村的技术骨干力量，建立一支由基层农技推广部门、科研院所、高校、行业协会、企业组成的多元化的农业科技推广队伍。
2.建立以人为本，开放、流动、竞争、协作的激励机制
强化人才激励机制，建立健全以政府奖励为引导，科技成果作为生产要素参与分配为主的创新激励机制，营造有力于各类人才创新、创业的良好环境。充分调动农业科技人员参加农业科学研究与农业科技成果推广的积极性。建立健全人才引进机制，给予优惠政策，加快引进和培养高层次人才、紧缺人才，吸引并聚集一批海内外优秀人才为我省服务。鼓励高新技术企业建立博士后科研工作站，结合科技创新平台和重点项目引进，吸纳和形成一批具有国际一流研发能力的骨干人才和团队。
（三） 构建农业科技创新运行机制体系
1.改革科技项目管理体制，强化项目目标考核评估
按轻重缓急、分步实施原则，重大专项实行“3＋2”模式管理，前三年完成质量好的项目后两年滚动支持。健全和规范科技项目申报、评估、立项、检查、考核制度，实施“信誉管理”，对参与评审公正客观的专家树立信誉鼓励，对项目执行完成质量好的团队实行信誉奖励。强化项目目标考核，严格按合同指标进行验收，对未能完成合同指标的科研团队实行中止两年申报的惩罚性制度。
2.改善科技合作机制，鼓励产学研合作联合攻关
重大科研项目可实行首席科学家制度，在重大突破领域采取多学科联合攻关，改善科研合作机制，建立科研平台和科技资源的共享机制，鼓励产学研合作，促进科技成果的快速转化。
3.建立国内外合作交流机制，促进我省农业科技水平的提高
建立泛珠三角区域农业科技发展协作机制。建立长期稳定的合作关系，实现仪器设备相互开放，科技资源共享，形成区域科技竞争优势，构建泛珠三角区域农业创新协作体系。抓住实施内地与香港、澳门关于建立更紧密经贸关系（CEPA）的历史机遇，鼓励香港、澳门的高等学校和科研机构与我省有关农业单位联合建立实验室，联合申报重大科研项目。
对于一些高新技术学科，以跟踪国际科技前沿、提高科技水平为目标，进一步扩大与国际学术组织、科研机构的合作领域，引进技术、人才和资金。积极推动高层次的国际学术交流活动，进一步提升广东的学术氛围和学术地位。
积极将一些我省有优势且知识产权明确农业技术成果、高新技术产品、农业生产设备等输出到具有比较优势的国家去，占领国外市场，如在水稻、蚕桑、热带亚热带果树、蔬菜的资源与育种方面，要从技术产业化战略的高度，可在互利互惠的原则下，向东南亚等一些国家输出技术与种子种苗。加强政府引导，有目的地组织整合省内的科技与产业资源，鼓励将高新技术成果进行境外开发，积极探索海外科技园区合作建设模式，培育一批具有国际竞争力的农业科技企业和集团，在东南亚、东北亚、非洲、拉美等发展中国家建立一批示范窗口、走出国门，把农业科技产品与服务打入国际市场。